Het orgel werd in 1953 gebouwd door de firma Marcussen & Søn uit Aabenraa (Denemarken) in opdracht van de NCRV. Het orgel werd gebouwd volgens de toenmalige inzichten in de stijl van een orgel uit de tijd van Sweelinck. Het kreeg dan ook al snel de naam "Sweelinck-orgel". Belangrijkste adviseurs bij de bouw waren M. Geerink Bakker en Frits Mehrtens. Het werd op 2 oktober 1953 officieel in gebruik genomen. De firma Marcussen reviseerde het orgel in 1974. In 2000 werd het overgeplaatst naar de Nicolaïkerk door de firma Van Vulpen. Daar werd het als koororgel in gebruik genomen op 16 december 2000 met een speciaal concert door Stephen Taylor, met medewerking van de Marcussen-Cantorij. Stephen Taylor opende het concert met een Toccata van Sweelinck. Het orgel is in bruikleen gegeven aan de Nicolaïkerk door de NCRV.
De dispositie van het Sweelinckorgel (Marcussen, 1953) is:
Hoofdwerk (C-f3):
Roerfluit 8' Prestant 4' Woudfluit 2' Mixtuur IV Dulciaan 8'
Bovenwerk (C-f3):
Gedekt 8' Roerfluit 4' Prestant 2' Nasard 1 1/3 Sequialtera II Cymbel I
Via de site van de orgelconcerten van de NCRV is o.a. een concert te horen, dat organist Klaas Bartlema in 1963 gaf vanuit de NCRV studio te Hilversum op dit Marcussen orgel.
