De kerk werd gebouwd door aannemer L. Goossen onder architectuur van de architecten Van Velzen en Oskam. Het gebouw werd in oktober 1923 in gebruik genomen. De eerste steen was gelegd op 30 april 1923 door oud-oefenaar W. Vermeer, die van 1901-1918 de gemeente diende. De gemeente heette toen Christelijke Afgescheiden Gemeente en had daarvoor 80 jaar gekerkt in het Heuvelkerkje (ook wel 'Schapenkerkje' genoemd naar de voorganger W. Schaap).
Het orgel
De firma Dekker bouwde in 1914 een mechanisch orgel met één manuaal en aangehangen pedaal. Het instrument werd later (1939/1940) uitgebreid met een pneumatisch Subbas 16' op het pedaal en de bas van de Prestant 8' op het manuaal. De firma Verschueren uit Heythuysen restaureerde het orgel in 1970. Het werd toen ook uitgebreid met een tweede klavier. De pneumatische tractuur werd geheel verwijderd. Op 24 december 1970 werd het in gebruik genomen met een bespeling door de adviseur Chr. Haalboom en door de plaatselijke organist, dhr. J.W. Baan. In 1981 werd besloten het orgel opnieuw te laten vernieuwen en restaureren. De opdracht ging naar firma Van den Heuvel uit Dordrecht. Van de 16 registers bleven er slechts 5 bewaard. De rest is vervangen. Er werd een nieuwe windvoorziening gemaakt, de pedaalmechaniek werd vernieuwd en er werd een nieuwe orgelkas gebouwd. Het gemeentelid chr. W.C. Bor uit deze Christelijke Gereformeerde Kerk maakte het houtsnijwerk. Tijdens een speciale kerkdienst op 29 december 1984 werd het orgel weer in gebruik genomen. Organist was toen Hans Boelee.
De dispositie van het Van den Heuvel orgel (1984) is:
Hoofdwerk (C-f3) :
Prestant 8' Roerfluit 8' Octaaf 4' Blokfluit 4' Octaaf 2' Cornet V (discant) Mixtuur III-IV Trompet 8' Tremulant
De organisten van de Christelijke Gereformeerde Kerk in Zeist zijn Bert Blankenstein, Jan van Ledden, Willem Hendrik van Ledden, Jan Meijer en Albert van der Veer (tot november 2008) (info 2008)